RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa12.09□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 H7BYZ3 331 aa12.09□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 BCL2L11O43521 198 aa12.09□□□□□ -0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.04□□□□□ -0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 CD300CQ08708 224 aa12.03□□□□□ -0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 Q8TAT8 98 aa12.01□□□□□ -0.49
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RABGEF1-204ENST00000442563 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
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RABGEF1-204ENST00000442563 GGTLC3B5MD39 225 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EQM0 130 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 FHITP49789 147 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 GNG5P63218 68 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
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