RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 C20orf173Q96LM9 149 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 GNG13Q9P2W3 67 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 XCL2Q9UBD3 114 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 MUC4Q99102 2169 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GVY2 172 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 UBE2G2P60604 165 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZTC4 211 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ZNF738Q8NE65 137 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 FXYD5Q96DB9 178 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 PKHD1P08F94 4074 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 IFNA1P01562 189 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 IGLC2P0DOY2 106 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 DNAH2Q9P225 4427 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 H3BQ15 152 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 TOR2AQ5JU69 321 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 COMMD7Q86VX2 200 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 C17orf77Q96MU5 243 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 MANBALQ9NQG1 85 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-210ENST00000442481 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 A0A087X0K7 114 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YX75 114 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PAGE4O60829 102 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PPT1P50897 306 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PSG9Q00887 426 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 GUK1Q16774 197 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 FAM210BQ96KR6 192 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 TMEM189A5PLL7 270 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 LINC00862A6NCI5 91 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SLC17A3O00476 420 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 BCL2P10415 239 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 ATP5G3P48201 142 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 RANP62826 216 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 CST9LP1Q5W188 147 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SUN5Q8TC36 379 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 FAM210AQ96ND0 272 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 X6R8D5 127 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 FAM74A7A6NL05 159 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 NDUFB4O95168 129 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PSG3Q16557 428 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 Q9H3A6 140 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 MED9Q9NWA0 146 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 VAX2Q9UIW0 290 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 AGRNO00468 2067 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PRE2 83 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 GGTLC3B5MD39 225 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 M0R2N4 97 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 M0R2Z0 102 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 RTL8CO15255 209 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 EMP1P54849 157 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 PDE6HQ13956 83 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 ICAM4Q14773 271 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 TREM1Q9NP99 234 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-210ENST00000442481 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms