RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431099.3

CBWD1-208, Transcript of COBW domain containing 1, human

TSL 5

Gene CBWD1, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD1-208	ENST00000431099	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PKD1	P98161	4303 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099		H7BYZ3	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PRAF2	O60831	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CAMLG	P49069	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SULT1A1	P50225	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	DAD1	P61803	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	IL15RA	Q13261	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ASAH1	Q13510	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099		F6UB75	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RLN2	P04090	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	NMB	P08949	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CAV2	P51636	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	BAX	Q07812	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	FGL1	Q08830	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	MGST2	Q99735	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	NMES1	Q9C002	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099		H3BNG1	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099		M0R2Z0	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GAGE7	O76087	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ATP5G1	P05496	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PET100	P0DJ07	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ATP5G3	P48201	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	BCAP31	P51572	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	EMP1	P54849	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	FXYD7	P58549	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	DEFB1	P60022	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RHOB	P62745	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GAGE1	Q13065	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	GAGE4	Q13068	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	RYR1	P21817	5038 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099		E5RGE8	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD1-208	ENST00000431099	CCNK	O75909	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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