RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 CCL19Q99731 98 aa15.26■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM70Q9BUB7 260 aa15.26■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 IGLL1P15814 213 aa15.26■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 UBE2E1P51965 193 aa15.26■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.26■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 GOSR1O95249 250 aa15.25■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 BLCAPP62952 87 aa15.25■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 Q6ZS46 218 aa15.25■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 UFC1Q9Y3C8 167 aa15.25■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 H3BUX3 64 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 GAS8-AS1O95177 125 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF492Q9P255 531 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 PRR25Q96S07 402 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.24■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 SCGB2A1O75556 95 aa15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 CKS2P33552 79 aa15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 IGLC3P0DOY3 106 aa15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 AP5S1Q9NUS5 200 aa15.23■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC140Q96MF4 163 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 DUX5Q96PT3 197 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 UQCR10Q9UDW1 63 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 RNF24Q9Y225 148 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 C2orf70A6NJV1 201 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 STPG4Q8N801 248 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 C16orf92Q96LL3 132 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 KLK15Q9H2R5 256 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 IGF1P05019 195 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 PSG9Q00887 426 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 ATP5G2Q06055 141 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 PRELID3AQ96N28 172 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 S100A7AQ86SG5 101 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 Q8N6K4 173 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 NDFIP1Q9BT67 221 aa15.21■□□□□ 0.03
TTLL3-210ENST00000427220 OR5AL1P0C617 328 aa15.21■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 F6UB75 175 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 ACANP16112 2415 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 MTORP42345 2549 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 IGKV3-20P01619 116 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 RASL11AQ6T310 242 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF502Q8TBZ5 544 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 METTL26Q96S19 204 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa15.2■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 TRAV41A0A0B4J266 112 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 HSBP1L1C9JCN9 74 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 CLEC2AQ6UVW9 174 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 NPSP0C0P6 89 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa15.19■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 PRSS57Q6UWY2 283 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF738Q8NE65 137 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 AJUBAQ96IF1 538 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 HAX1O00165 279 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 ARL3P36405 182 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 FOXE3Q13461 319 aa15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 EDN2P20800 178 aa15.17■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 PAX2Q02962 417 aa15.17■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 PIMREGQ9BSJ6 248 aa15.17■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 C20orf202A1L168 122 aa15.17■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 BUB3O43684 328 aa15.17■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 CT83Q5H943 113 aa15.17■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa15.17■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 NPYP01303 97 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 IGHG4P01861 327 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 TSPOP30536 169 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM78Q5T7P6 136 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 C5orf56Q8N8D9 126 aa15.16■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 CTRLP40313 264 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 KIR3DS1Q14943 382 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 LYPD1Q8N2G4 141 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL3-210ENST00000427220 USP24Q9UPU5 2620 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.2 ms