RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLGA8IPA6NC78 632 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKCP01834 107 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOC1P02654 83 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 ISG15P05161 165 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCL2P19875 107 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL1P22362 96 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAPZBP47756 277 aa-3.16□□□□□ -2.92
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 FADDQ13158 208 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 ULK3Q6PHR2 472 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYS1Q8N2H4 156 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOMM6Q96B49 74 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM12Q96EX1 92 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM126AQ9H061 195 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELOVL6Q9H5J4 265 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 HYPKQ9NX55 129 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANK1P16157 1881 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRIQ4A6NIV6 560 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFB3O43676 98 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCL3P19876 107 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDTP30046 118 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 AESQ08117 197 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB125Q8N687 156 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4B1Q8NGF8 309 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 MROQ9BYG7 248 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR97A6NE52 1622 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 FMN2Q9NZ56 1722 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 DISC1C4P0D8 188 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 F5H5K5 113 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3KT08 172 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL3L1P16619 93 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIGPP57054 158 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10A3P58181 314 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB8AP61006 207 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2HP62256 183 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCN2P80188 198 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOHQ15669 191 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5A2Q8NGI9 324 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNBD2Q96M20 576 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD7Q96MP8 289 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 SELENOSQ9BQE4 189 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO44Q9H4M3 255 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYSLTR1Q9Y271 337 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF15Q9NS87 1388 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 NINLQ9Y2I6 1382 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP-3.18□□□□□ -2.92
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM189A5PLL7 270 aa-3.19□□□□□ -2.92
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-3.19□□□□□ -2.92
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RNU6-172P-201ENST00000411000 JOSD2Q8TAC2 188 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIB1Q99828 191 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 V9GYY9 64 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSMD2Q7Z408 3487 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-3.2□□□□□ -2.92
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RNU6-172P-201ENST00000411000 IL7P13232 177 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 GAP43P17677 238 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN12P56749 244 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H3AP68431 136 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP-3.2□□□□□ -2.92
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RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR6V1Q8N148 313 aa-3.2□□□□□ -2.92
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RNU6-172P-201ENST00000411000 WFDC6Q9BQY6 131 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM96AQ9H5X1 160 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYRM4Q9HD34 91 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENY2Q9NPA8 101 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf12Q9NSK7 152 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAS2R3Q9NYW6 316 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRC1P22897 1456 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM92AA1XBS5 289 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL5CA6NH57 179 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2H2O95918 312 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT1FP04733 61 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 RANBP1P43487 201 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-DRB5Q30154 266 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5AK3PQ8NH89 298 aa-3.21□□□□□ -2.92
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