RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB131AP59861 70 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 ADIRFQ15847 76 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 CENPWQ5EE01 88 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 C20orf173Q96LM9 149 aa21.99■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 DIRC3C9JPN6 131 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 K7EQM0 130 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM12Q96EX1 92 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 RPS10P5Q9NQ39 176 aa21.98■■□□□ 1.11
ECHS1-201ENST00000368547 C19orf73Q9NVV2 129 aa21.98■■□□□ 1.11
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ECHS1-201ENST00000368547 LINC00479Q96M42 142 aa21.98■■□□□ 1.11
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ECHS1-201ENST00000368547 APRG1Q8IVJ8 170 aa21.96■■□□□ 1.11
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ECHS1-201ENST00000368547 ISOC2Q96AB3 205 aa21.95■■□□□ 1.1
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM242Q9NWH2 141 aa21.95■■□□□ 1.1
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV34A0A0B4J273 112 aa21.94■■□□□ 1.1
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ECHS1-201ENST00000368547 DEFB1P60022 68 aa21.93■■□□□ 1.1
ECHS1-201ENST00000368547 BTN1A1Q13410 526 aa21.93■■□□□ 1.1
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF738Q8NE65 137 aa21.93■■□□□ 1.1
ECHS1-201ENST00000368547 CTDSP1Q9GZU7 261 aa21.93■■□□□ 1.1
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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ECHS1-201ENST00000368547 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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ECHS1-201ENST00000368547 SMCO4Q9NRQ5 59 aa21.92■■□□□ 1.1
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ECHS1-201ENST00000368547 TUBA4BQ9H853 241 aa21.91■■□□□ 1.1
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ECHS1-201ENST00000368547 GCGP01275 180 aa21.9■■□□□ 1.1
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ECHS1-201ENST00000368547 PRAC2D3DTV9 90 aa21.86■■□□□ 1.09
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ECHS1-201ENST00000368547 SRD5A3Q9H8P0 318 aa21.86■■□□□ 1.09
ECHS1-201ENST00000368547 AGRNO00468 2067 aa21.86■■□□□ 1.09
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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ECHS1-201ENST00000368547 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHS1-201ENST00000368547 PRNTQ86SH4 94 aa21.84■■□□□ 1.09
ECHS1-201ENST00000368547 OR8A1Q8NGG7 326 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 OSTCQ9NRP0 149 aa21.83■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 H7BYZ3 331 aa21.82■■□□□ 1.08
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ECHS1-201ENST00000368547 FAM231DQ6ZW35 169 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 STHQ8IWL8 128 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa21.82■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 OR5I1Q13606 314 aa21.81■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa21.81■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 COX8CQ7Z4L0 72 aa21.81■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 OR10G8Q8NGN5 311 aa21.81■■□□□ 1.08
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa21.81■■□□□ 1.08
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