RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DENND4CQ5VZ89 1909 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CACNA1EQ15878 2313 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYH10P35580 1976 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FREM3P0C091 2139 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NUMA1Q14980 2115 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DOCK5Q9H7D0 1870 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CECR2Q9BXF3 1484 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A0D9SFI3 127 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1B0GV72 72 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C9JAW5 83 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSTD3H0UI37 97 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC179H3BU77 68 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 J3QR89 54 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EDF1O60869 148 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DBIP07108 87 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD14P08571 375 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CTXN2P0C2S0 81 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 S100GP29377 79 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SERPINB9P50453 376 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARPP19P56211 112 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DEFA3P59666 94 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KLKP1Q107X0 134 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HSD17B12Q53GQ0 312 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 Q5BKY6 102 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C1orf134Q5TEV5 83 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SCIMPQ6UWF3 145 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMIM15Q7Z3B0 74 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VMO1Q7Z5L0 202 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARL17AQ8IVW1 177 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MMGT1Q8N4V1 131 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLAC4Q8WY50 150 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAFIPQ8WZ33 124 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLEKHB2Q96CS7 222 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM141Q96I45 108 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GINS3Q9BRX5 216 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IL20Q9NYY1 176 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TP73-AS1Q9UF72 201 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPAG17Q6Q759 2223 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HEATR5AQ86XA9 2040 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ECM29Q5VYK3 1845 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MIA2Q96PC5 1412 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTL9Q8NET4 1388 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ROBO3Q96MS0 1386 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MAST4O15021 2626 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MGAMO43451 1857 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SBF1O95248 1867 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DSPPQ9NZW4 1301 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LAMA4Q16363 1823 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C9orf170A2RU37 121 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UQCRQO14949 82 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NPFFO15130 113 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DPM2O94777 84 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BRI3O95415 125 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGF2P01344 180 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IFNA17P01571 189 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCKP06307 115 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CXCL1P09341 107 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COX4I1P13073 169 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PCBD1P61457 104 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NCS1P62166 190 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LSM6P62312 80 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GNG3P63215 75 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLGLB1Q02325 96 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF56Q15929 161 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPRNQ5BIV9 151 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TOMM20LQ6UXN7 152 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LYG2Q86SG7 212 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 Q8IYB0 196 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TCTE3Q8IZS6 198 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C4orf33Q8N1A6 199 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TET1Q8NFU7 2136 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR52R1Q8NGF1 315 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR5A2Q8NGI9 324 aa0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms