RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 PROP1O75360 226 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 NDUFA7O95182 113 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 OCC1Q8TAD7 63 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 RHODO00212 210 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 C5orf30Q96GV9 206 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 LINC01548A6NM66 108 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 CSTL1Q9H114 145 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 LAMA3Q16787 3333 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 GCSHP23434 173 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF876PQ49A33 203 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ORMDL3Q8N138 153 aa8.39□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PPBPP02775 128 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ELOBQ15370 118 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 DIRC3C9JPN6 131 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 CYYR1Q96J86 154 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SH2D1AO60880 128 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRR20EP86478 221 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRR20CP86479 221 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRR20DP86480 221 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRR20BP86481 221 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRR20AP86496 221 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 A0A0C4DFX4 3053 aa8.38□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF702PQ9H963 129 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SLAQ13239 276 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PMS2P11Q13670 270 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 BATFQ16520 125 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 BUB3O43684 328 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SRIP30626 198 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 UTF1Q5T230 341 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TSKUQ8WUA8 353 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 Q86TA4 180 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 IL17DQ8TAD2 202 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.37□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE12BA1L429 117 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE7O76087 117 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 IGLV2-14P01704 120 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE12FP0CL80 117 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE12GP0CL81 117 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 GAGE12IP0CL82 117 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRR31Q5SQ13 230 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 NUDT11Q96G61 164 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SPXQ9BT56 116 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PSCAO43653 123 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.36□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 E7EUB6 86 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 C1orf159Q96HA4 380 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRSS2P07478 247 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 AZU1P20160 251 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 SMIM12Q96EX1 92 aa8.35□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 A8MWV9 139 aa8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 IL15RAQ13261 267 aa8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PRR25Q96S07 402 aa8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 LGALS9O00182 355 aa8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 TRBV12-3P01733 135 aa8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PTTG1IPP53801 180 aa8.34□□□□□ -1.07
SEC24C-201ENST00000339365 PLP1P60201 277 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms