RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 SRRM5B3KS81 715 aa8.54□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 MMP23AO75900 390 aa8.54□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 TRGV9Q99603 122 aa8.54□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 LINC00587B1AMM8 73 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 J3QKU1 62 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 IGHG3P01860 377 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 HSD52Q0P140 79 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 MST1LQ2TV78 715 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 TNFRSF14Q92956 283 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-19P01714 112 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 GFI1Q99684 422 aa8.53□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 OBSL1O75147 1896 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 NRGNQ92686 78 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 DSCR8Q96T75 97 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 KIR3DS1Q14943 382 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 BTCP35070 178 aa8.52□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 C5orf47Q569G3 176 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 HLA-DRB4P13762 266 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GUS0 222 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 NDUFB8O95169 186 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHV1-69P01742 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 TMEM243Q9BU79 118 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 SEC11AP67812 179 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PPI3 338 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 ARTNQ5T4W7 220 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 LTBP1Q14766 1721 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CRYGSP22914 178 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 Q6P435 159 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-30P01768 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-33P01772 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IFI6P09912 130 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 EP400Q96L91 3159 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CRYGCP07315 174 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 DEFB4AO15263 64 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CRLF1O75462 422 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 I3L3M4 83 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 K7ENP7 123 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 BUB3O43684 328 aa8.49□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 A0A0G2JRQ6 117 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 AMBPP02760 352 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CD5P06127 495 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 MPV17L2Q567V2 206 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 TMEM131Q92545 1883 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 GAS1P54826 345 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 NOTCH4Q99466 2003 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 SOCS3O14543 225 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 NDUFS7O75251 213 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 ID3Q02535 119 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 WIPF3A6NGB9 483 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 F6UB75 175 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 LINC01551Q86U37 167 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CCL24O00175 119 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 C15orf62A8K5M9 175 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHG4P01861 327 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 LYPD3O95274 346 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 HLA-DMBP28068 263 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.47□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.46□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 K7EMI3 77 aa8.46□□□□□ -1.05
CLN8-201ENST00000331222 SLURP1P55000 103 aa8.46□□□□□ -1.05
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