RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326039.3

GRTP1-201, Transcript of growth hormone regulated TBC protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GRTP1, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1-201ENST00000326039 STAG3L2P0CL84 134 aa14.68□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 STAG3L3P0CL85 134 aa14.68□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.68□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.68□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 H7BYZ3 331 aa14.67□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.67□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 SUN5Q8TC36 379 aa14.67□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.67□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 PGPA6NDG6 321 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 J3KRW8 73 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 CSN1S1P47710 185 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 Q6ZNX1 250 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 OTORQ9NRC9 128 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.66□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 RBAKDNA6NC62 111 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 KLLNB2CW77 178 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 DIRC3C9JPN6 131 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 HTN1P15515 57 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 CRISP2P16562 243 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF345Q14585 488 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF492Q9P255 531 aa14.65□□□□□ -0.06
GRTP1-201ENST00000326039 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 NMBP08949 121 aa14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 SSX7Q7RTT5 188 aa14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 HYLS1Q96M11 299 aa14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.64□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 IGLL5B9A064 214 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 GCHFRP30047 84 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF138P52744 262 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 CD300CQ08708 224 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF726P1Q15940 193 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 A0A0D9SG52 128 aa14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 C7orf71A4D174 169 aa14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 CXorf1O96002 111 aa14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 APLNQ9ULZ1 77 aa14.62□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 LYRM9A8MSI8 78 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 GPX1P07203 203 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 TCTAP57738 103 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 BTN1A1Q13410 526 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 C16orf74Q96GX8 76 aa14.61□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.6□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 PRR9Q5T870 116 aa14.6□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.6□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 Q8TAT8 98 aa14.6□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.6□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.6□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.59□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 DAD1P61803 113 aa14.59□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.59□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GRTP1-201ENST00000326039 LY6G6CO95867 125 aa14.58□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 Q6ZQT7 251 aa14.58□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.58□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 TMED6Q8WW62 240 aa14.58□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.58□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 BCL2L11O43521 198 aa14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 GNG5P63218 68 aa14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 TMUB2Q71RG4 321 aa14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.57□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 SEC11BP0C7V7 166 aa14.56□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 DEFB130BP0DP73 79 aa14.56□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 DEFB130AP0DP74 79 aa14.56□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.56□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.55□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.55□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.55□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 A0A1W2PRE2 83 aa14.54□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 GGTLC3B5MD39 225 aa14.54□□□□□ -0.08
GRTP1-201ENST00000326039 FHITP49789 147 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms