RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 SORL1Q92673 2214 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 B4DEV8 164 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 RHEBQ15382 184 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 MLST8Q9BVC4 326 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC71-201ENST00000321895 ERCC8Q13216 396 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 K7EN84 100 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ISOC2Q96AB3 205 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 LINC00477Q96M19 166 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 C7orf77A4D0Y5 90 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 F6UB75 175 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 GCGP01275 180 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF138P52744 262 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 DEFB1P60022 68 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 Q8TAT8 98 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 PRR25Q96S07 402 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 DEFB131AP59861 70 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 BIN3Q9NQY0 253 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF492Q9P255 531 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 LENEPQ9Y5L5 61 aa14.68□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 A0A0J9YX75 114 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 OR5I1Q13606 314 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.66□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 A0A087WWC5 75 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 MT-ND4LP03901 98 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 SFRP2Q96HF1 295 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 ASCL2Q99929 193 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 RNF212Q495C1 297 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 C8orf49Q96NF6 230 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.65□□□□□ -0.06
CCDC71-201ENST00000321895 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 WIPF1O43516 503 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CT45A10P0DMU9 189 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 OR11H12B2RN74 326 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 PRR27Q6MZM9 219 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R2P9O14990 202 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 IGLL1P15814 213 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ERVFC1-1P60608 527 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 SMUG1Q53HV7 270 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ODF3Q96PU9 254 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 OSTCQ9NRP0 149 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 AGRNO00468 2067 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 HLA-DRB4P13762 266 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 MDFIQ99750 246 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 KNCNA6PVL3 124 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 SCO1O75880 301 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 A8MTW9 85 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 CRISP2P16562 243 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 H3BMM0 161 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 H7BYZ3 331 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 PRR31Q5SQ13 230 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC71-201ENST00000321895 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms