RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa16.47■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 C9JCJ5 164 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 TMEM241Q24JQ0 296 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 GDF5OSQ5U4N7 250 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 FOXI2Q6ZQN5 318 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 OR11H12B2RN74 326 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 CD7P09564 240 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 OXLD1Q5BKU9 147 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 TMEM78Q5T7P6 136 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 BAGE2Q86Y30 109 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 LINC00477Q96M19 166 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 NAT8Q9UHE5 227 aa16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CTU2-201ENST00000312060 A0A0J9YX75 114 aa16.45■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa16.45■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 Q86TA4 180 aa16.45■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 APRG1Q8IVJ8 170 aa16.45■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa16.45■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 PGPEP1LA6NFU8 196 aa16.44■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 NPIPB6E9PJ23 425 aa16.44■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 LTAP01374 205 aa16.44■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 APOC3P02656 99 aa16.44■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 ZNF124Q15973 351 aa16.44■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 Q8TAT8 98 aa16.44■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 ASCL2Q99929 193 aa16.44■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 ZNF138P52744 262 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 SDF2L1Q9HCN8 221 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 KNCNA6PVL3 124 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 ACTL10Q5JWF8 245 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 NHLRC2Q8NBF2 726 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 OCC1Q8TAD7 63 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 TVP23CQ96ET8 276 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 ZNF492Q9P255 531 aa16.43■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 S100A1P23297 94 aa16.42■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 GTSCR1Q86UQ5 136 aa16.42■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 PRR25Q96S07 402 aa16.42■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa16.42■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 IGLV2-8P01709 118 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 CT45A10P0DMU9 189 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 HLA-DRB4P13762 266 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 TMEM183AQ8IXX5 376 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 OR4B1Q8NGF8 309 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 NDFIP1Q9BT67 221 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 LY96Q9Y6Y9 160 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.41■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 RPL23P62829 140 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 LINC01551Q86U37 167 aa16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 SMIM12Q96EX1 92 aa16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 MLST8Q9BVC4 326 aa16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 H3BMM0 161 aa16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 IGKV3-20P01619 116 aa16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 MGST1P10620 155 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 ADIRFQ15847 76 aa16.4■□□□□ 0.22
CTU2-201ENST00000312060 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 C8orf49Q96NF6 230 aa16.39■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 LENEPQ9Y5L5 61 aa16.39■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 SVBPQ8N300 66 aa16.38■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.38■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 K7EN84 100 aa16.37■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 M0R036 132 aa16.37■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 STHQ8IWL8 128 aa16.37■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 FAM19A4Q96LR4 140 aa16.37■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 G3V4G9 280 aa16.36■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 GCGP01275 180 aa16.36■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 OR5I1Q13606 314 aa16.36■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa16.35■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.35■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 SMUG1Q53HV7 270 aa16.35■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 PRR27Q6MZM9 219 aa16.35■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 CLRN3Q8NCR9 226 aa16.35■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16.35■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 ODF3Q96PU9 254 aa16.35■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 A8MTW9 85 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 COX8CQ7Z4L0 72 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 DEFB125Q8N687 156 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 ISOC2Q96AB3 205 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 BIN3Q9NQY0 253 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 SNAPINO95295 136 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP10-11P60412 298 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 AMTNQ6UX39 209 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa16.34■□□□□ 0.21
CTU2-201ENST00000312060 J3KRW8 73 aa16.33■□□□□ 0.2
CTU2-201ENST00000312060 CRISP2P16562 243 aa16.33■□□□□ 0.2
CTU2-201ENST00000312060 Q8N1Y9 231 aa16.33■□□□□ 0.2
CTU2-201ENST00000312060 CLUHP3Q96NS8 147 aa16.33■□□□□ 0.2
CTU2-201ENST00000312060 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTU2-201ENST00000312060 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 167 ms