RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRB-201ENST00000261266 C16orf74Q96GX8 76 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRB-201ENST00000261266 RNF223E7ERA6 249 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRB-201ENST00000261266 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 I3L2K1 104 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 A0A087WWL8 130 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 MPV17L2Q567V2 206 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 ODF3Q96PU9 254 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 IGLC3P0DOY3 106 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF124Q15973 351 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 GP9P14770 177 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-201ENST00000261266 WIPF3A6NGB9 483 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 SMKR1H3BMG3 65 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 CXCL5P42830 114 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 C9JQL5 133 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 GPHB5Q86YW7 130 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-201ENST00000261266 CTSZQ9UBR2 303 aa7.1□□□□□ -1.27
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