RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 DNHD1Q96M86 4753 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 STAB1Q9NY15 2570 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYGBP07316 175 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RIGQ13278 110 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6AWC8 147 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 APOHP02749 345 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOGP84095 191 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR1DP28221 377 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPD1Q8N2G4 141 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C5Q8NGB2 326 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 PIFOQ8TCI5 191 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MEGF9Q9H1U4 602 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SGK494Q96LW2 274 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SCRT2Q9NQ03 307 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GUT8 65 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN1BP46527 198 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM75Q8N9X5 138 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TPSG1Q9NRR2 321 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 LY6LH3BQJ8 138 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BUX3 64 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EQM0 130 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CD24P25063 80 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB125Q8N687 156 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 DPM3Q9P2X0 92 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC9Q9Y336 463 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 RBX1P62877 108 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 LY6EQ16553 131 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01545Q5VT33 79 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV2-11P01706 119 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MPV17L2Q567V2 206 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 DPF1Q92782 380 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 JMJD8Q96S16 334 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF5Q99942 180 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MINOS1Q5TGZ0 78 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLC1P0CG04 106 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 VAMP3Q15836 100 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A7AQ86SG5 101 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CSN1S1P47710 185 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 RITA1Q96K30 269 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT3O95989 172 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG1P11464 419 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R27Q86WC6 154 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 AP5S1Q9NUS5 200 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 hDV102S1A0JD36 115 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QZ24 198 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RASL11BQ9BPW5 248 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TAX1BP3O14907 124 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 LYZP61626 148 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00173Q6ZV60 143 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PRNTQ86SH4 94 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX22C9J3V5 150 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM219Q86XT9 240 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10AG1Q8NH19 301 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV19A0A075B6N1 114 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 VPREB3Q9UKI3 123 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 I3L2K1 104 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF493Q6ZR52 646 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM86BQ8N661 226 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM158Q8WZ71 300 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 RPEQ96AT9 228 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 COX8AP10176 69 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZVH6 145 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 FA2HQ7L5A8 372 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF747Q9BV97 191 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM23O14925 209 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BRN7 92 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM3P40198 252 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG3Q16557 428 aa20.39■□□□□ 0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR183P32249 361 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC11AP67812 179 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD39Q53RE8 183 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1N2Q8NGR9 330 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 CFHR4Q92496 578 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 PSG8Q9UQ74 426 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BTX0 84 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE6HQ13956 83 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.7 ms