RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637671.1

SYNGAP1-223, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CTDSPL	O15194	276 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PSCA	O43653	123 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	VAMP1	P23763	118 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IL18	Q14116	193 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ARV1	Q9H2C2	271 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		7.95	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRAC2	D3DTV9	90 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IGHV3-53	P01767	116 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		7.94	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C7orf71	A4D174	169 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SLC17A3	O00476	420 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SPINK4	O60575	86 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CRYGD	P07320	174 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CT45A10	P0DMU9	189 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SRI	P30626	198 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TCL1A	P56279	114 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PATE2	Q6UY27	113 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ZNF546	Q86UE3	836 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C8orf49	Q96NF6	230 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		7.93	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671		H3BTX0	84 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671		K7EPK0	472 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	GOSR2	O14653	212 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	COX7A2P2	O60397	106 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CRYBA4	P53673	196 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CTF1	Q16619	201 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TEPP	Q6URK8	271 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	VGLL1	Q99990	258 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		7.92	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CTDSP2	O14595	271 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRAF2	O60831	178 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C1QB	P02746	253 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	HOXB5	P09067	269 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	GUK1	Q16774	197 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		7.91	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FNDC10	F2Z333	226 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RGS13	O14921	159 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SSSCA1	O60232	199 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MPDU1	O75352	247 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	IGLC2	P0DOY2	106 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C4orf46	Q504U0	113 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.9	□□□□□ -1.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KLLN	B2CW77	178 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671		E5RGE8	158 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671		K7EQD1	137 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SFT2D2	O95562	160 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ORM1	P02763	201 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	OR4E1	P0C645	316 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ZNF415	Q09FC8	603 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BTN1A1	Q13410	526 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	FHL2	Q14192	279 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	OPCML	Q14982	345 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q8N814	137 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		7.89	□□□□□ -1.15

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