RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 TEPPQ6URK8 271 aa11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.65□□□□□ -0.54
STX4-217ENST00000613541 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 J3KRW8 73 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 GOSR2O14653 212 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 HOXB5P09067 269 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 EVI2AP22794 236 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 AP3S2P59780 193 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 PATE2Q6UY27 113 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 ZNF546Q86UE3 836 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 PRO0255Q9UI72 69 aa11.64□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SFT2D2O95562 160 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 ID3Q02535 119 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 GUK1Q16774 197 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.63□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 PRAC2D3DTV9 90 aa11.62□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 CT45A10P0DMU9 189 aa11.62□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.62□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.62□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SMIM8Q96KF7 97 aa11.62□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 MYCBP2O75592 4640 aa11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 C7orf71A4D174 169 aa11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 COX7A2P2O60397 106 aa11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SPINK4O60575 86 aa11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 FAT1Q14517 4588 aa11.61□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 TCL1AP56279 114 aa11.6□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.6□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.6□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 FABP12A6NFH5 140 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SLC17A3O00476 420 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 PPP1R1AQ13522 171 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 LINC00477Q96M19 166 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 GGACTQ9BVM4 153 aa11.59□□□□□ -0.55
STX4-217ENST00000613541 AGPAT2O15120 278 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 SSSCA1O60232 199 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 ZNF253O75346 499 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 MPDU1O75352 247 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 SMIM18P0DKX4 95 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 IGLC2P0DOY2 106 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 CRYBA4P53673 196 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 RAB31Q13636 194 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 MCFD2Q8NI22 146 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 VGLL1Q99990 258 aa11.58□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 H3BTX0 84 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 PSCAO43653 123 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 SRIP30626 198 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 TAS2R30P59541 319 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 SPCS2Q15005 226 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 Q6ZRG5 221 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 PRELID1Q9Y255 219 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.57□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 KLLNB2CW77 178 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 RGS13O14921 159 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 PRAF2O60831 178 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 TSC22D2O75157 780 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 IGHV3-53P01767 116 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 OR4E1P0C645 316 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 OPCMLQ14982 345 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.56□□□□□ -0.56
STX4-217ENST00000613541 C8orf49Q96NF6 230 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms