RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 M6PRP20645 277 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF738Q8NE65 137 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 A8MTW9 85 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 TAAR5O14804 337 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF253O75346 499 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFB4O95168 129 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB2AP61019 212 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 RHOBP62745 196 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 STOML3Q8TAV4 291 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF503Q96F45 646 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR51M1Q9H341 326 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNA7P01567 189 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10J4P0C629 311 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 FXYD7P58549 80 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 PDE6HQ13956 83 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 AMTNQ6UX39 209 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 BLNKQ8WV28 456 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 FXYD5Q96DB9 178 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 RARRES2Q99969 163 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 PAXXQ9BUH6 204 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 XCL2Q9UBD3 114 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 PRAC2D3DTV9 90 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR7C2O60412 319 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 JTBO76095 146 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 SERF2P84101 59 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 PSG9Q00887 426 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 OR11H2Q8NH07 326 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF141Q8WVD5 230 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.23□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A0J9YWU9 116 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PPV4 95 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 M0R3E3 92 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 TAS2R45P59539 299 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 KHDC3LQ587J8 217 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 BAP18Q8IXM2 172 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 MUC7Q8TAX7 377 aa8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 X6R8D5 127 aa8.21□□□□□ -1.09
CCL3L3-201ENST00000612839 M0R2Z0 102 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 MBP02144 154 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ICAM4Q14773 271 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8NAQ8 132 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB24Q969Q5 203 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 STAG3L2P0CL84 134 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 STAG3L3P0CL85 134 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 RANP62826 216 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 CLLU1Q5K131 121 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 PRELID1Q9Y255 219 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB4AO15263 64 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 NMBP08949 121 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 MIFP14174 115 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF726P1Q15940 193 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFA5Q16718 116 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms