RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 PSG3Q16557 428 aa9.75□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 DDB2Q92466 427 aa9.75□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHG2P01859 326 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-209ENST00000607882 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 ENY2Q9NPA8 101 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGEF1-209ENST00000607882 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.74□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.73□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 F2Z2F3 143 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 SERF1AO75920 110 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 CRISP2P16562 243 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-209ENST00000607882 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZWC4 215 aa9.72□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 OR10J1P30954 320 aa9.71□□□□□ -0.85
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RABGEF1-209ENST00000607882 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.71□□□□□ -0.86
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RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf52Q96A22 123 aa9.71□□□□□ -0.86
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RABGEF1-209ENST00000607882 SLC35E1Q96K37 410 aa9.7□□□□□ -0.86
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-209ENST00000607882 TOMM40O96008 361 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-209ENST00000607882 TCL1AP56279 114 aa9.69□□□□□ -0.86
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RABGEF1-209ENST00000607882 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-209ENST00000607882 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGEF1-209ENST00000607882 GNB4Q9HAV0 340 aa9.69□□□□□ -0.86
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