RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF138P52744 262 aa8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 LYZP61626 148 aa8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 MBD6Q96DN6 1003 aa8.52□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 J3QR89 54 aa8.51□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.51□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.49□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 GTSF1Q8WW33 167 aa8.48□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 OR11H1Q8NG94 326 aa8.47□□□□□ -1.05
FCHO1-216ENST00000596536 OR11H2Q8NH07 326 aa8.47□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 HERV-K104P63124 156 aa8.47□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 THAP8Q8NA92 274 aa8.47□□□□□ -1.05
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FCHO1-216ENST00000596536 C18orf15Q96N68 181 aa8.46□□□□□ -1.06
FCHO1-216ENST00000596536 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.46□□□□□ -1.06
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FCHO1-216ENST00000596536 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.46□□□□□ -1.06
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FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.46□□□□□ -1.06
FCHO1-216ENST00000596536 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
FCHO1-216ENST00000596536 ARPC1AQ92747 370 aa8.46□□□□□ -1.06
FCHO1-216ENST00000596536 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.46□□□□□ -1.06
FCHO1-216ENST00000596536 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.45□□□□□ -1.06
FCHO1-216ENST00000596536 SHISA9B4DS77 424 aa8.45□□□□□ -1.06
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