RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNLRB2Q8TF09 96 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 DIRC3C9JPN6 131 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PAFAH1B2P68402 229 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 GUCA2BQ16661 112 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM183BQ1AE95 376 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 FMC1Q96HJ9 113 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 SDF2L1Q9HCN8 221 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 LY96Q9Y6Y9 160 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R3E3 92 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 ID1P41134 155 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2G1P62253 170 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 DCANP1Q8TF63 244 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 RPH3ALQ9UNE2 315 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV2A0A0B4J234 112 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG3Q16557 428 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 LCN12Q6JVE5 192 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A6AQ9H2W1 248 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV25A0A0B4J276 109 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM75Q8N9X5 138 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM158Q8WZ71 300 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF747Q9BV97 191 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RBAKDNA6NC62 111 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 GNG4P50150 75 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB114Q30KQ6 69 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM12Q96EX1 92 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN4O14817 238 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 ATRQ13535 2644 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00482Q8N8I6 264 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 CLRN3Q8NCR9 226 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EQG2 157 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DMBP28068 263 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFL4Q6B9Z1 124 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF182Q8N6D2 247 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 B4DEV8 164 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPWQ5EE01 88 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00479Q96M42 142 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R036 132 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL23P62829 140 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 GBGT1Q8N5D6 347 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 RHEBQ15382 184 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01551Q86U37 167 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV34A0A0B4J273 112 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM61Q8N0U2 210 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2K2Q8NGT1 345 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV2-11P01706 119 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 BAGE2Q86Y30 109 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF738Q8NE65 137 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 LTAP01374 205 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ADIRFQ15847 76 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 OCC1Q8TAD7 63 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP30Q9Y2G7 519 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 SELENOKQ9Y6D0 94 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 SAP30O75446 220 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf54Q6X4T0 127 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 Q86TA4 180 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC3Q8IUB2 231 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 C20orf173Q96LM9 149 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG8Q9UQ74 426 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 SHISA2Q6UWI4 295 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf56Q8N813 242 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C46A6NHA9 309 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV1-51P01701 117 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 BIN3Q9NQY0 253 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-206ENST00000588815 TENM1Q9UKZ4 2725 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PGPEP1LA6NFU8 196 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV2-8P01709 118 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 TFPI2P48307 235 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 INSL3P51460 131 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PRNTQ86SH4 94 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM183AQ8IXX5 376 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 MLST8Q9BVC4 326 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WWC5 75 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 C7orf77A4D0Y5 90 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAC2D3DTV9 90 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ISOC2Q96AB3 205 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SGK494Q96LW2 274 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ATRAIDQ6UW56 229 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10J6PQ8NGY7 276 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 GCGP01275 180 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM78Q5T7P6 136 aa23.24■■□□□ 1.31
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