RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 HMCN2Q8NDA2 5059 aa14.67□□□□□ -0.06
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CAPNS1-205ENST00000588780 SRIP30626 198 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 SELENOTP62341 195 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 MCUBQ9NWR8 336 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.66□□□□□ -0.06
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF415Q09FC8 603 aa14.65□□□□□ -0.06
CAPNS1-205ENST00000588780 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.65□□□□□ -0.06
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CAPNS1-205ENST00000588780 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 Q8N814 137 aa14.63□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 C7orf71A4D174 169 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC17A3O00476 420 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 TEPPQ6URK8 271 aa14.62□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 ODF3Q96PU9 254 aa14.62□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 VAMP1P23763 118 aa14.61□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A6P12236 298 aa14.6□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 Q9HAA7 133 aa14.6□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 ATP6V1G2O95670 118 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-205ENST00000588780 C1QBP02746 253 aa14.59□□□□□ -0.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-205ENST00000588780 PSENENQ9NZ42 101 aa14.58□□□□□ -0.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.53□□□□□ -0.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
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CAPNS1-205ENST00000588780 SSSCA1O60232 199 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-205ENST00000588780 CCNKO75909 580 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-205ENST00000588780 OR4E1P0C645 316 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-205ENST00000588780 IGLC2P0DOY2 106 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-205ENST00000588780 PPT1P50897 306 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-205ENST00000588780 GUK1Q16774 197 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-205ENST00000588780 MORN5Q5VZ52 161 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-205ENST00000588780 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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