RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	GALR1	P47211	349 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	TMED6	Q8WW62	240 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	FUT9	Q9Y231	359 aa		10.19	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507		A0A1W2PPV4	95 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507		A8MTW9	85 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	RAB5C	P51148	216 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	TAS2R45	P59539	299 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	RAB2A	P61019	212 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507		Q6ZTC4	211 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	RPRM	Q9NS64	109 aa		10.18	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	MEOX2	P50222	304 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	PSG9	Q00887	426 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	C12orf74	Q32Q52	190 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.17	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	KHDC3L	Q587J8	217 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	NEU1	Q99519	415 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	IGLL5	B9A064	214 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	PRM2	P04554	102 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	SULT1A2	P50226	295 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EDC4-210	ENST00000575507		A0A087X0K7	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.14	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	OR7C2	O60412	319 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	CXorf1	O96002	111 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	EMP1	P54849	157 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	GUK1	Q16774	197 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	TEX261	Q6UWH6	196 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507		H3BTX0	84 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507		M0R2Z0	102 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	IFNA7	P01567	189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	FHIT	P49789	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	PSG3	Q16557	428 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507		H3BQ15	152 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	SLC17A3	O00476	420 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF253	O75346	499 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	PDE6H	Q13956	83 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	FXYD5	Q96DB9	178 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EDC4-210	ENST00000575507	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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