RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 hADV29S1A0JD25 119 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 C5orf63A6NC05 138 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PRSS46E5RG02 174 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 F8W735 103 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 H3BTX0 84 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LGALS9O00182 355 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PRRG2O14669 202 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SYNGR2O43760 224 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 WISP1O95388 367 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 C1orf105O95561 183 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 EPPINO95925 133 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00271P0C7V0 271 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PIRTP0C851 137 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CTLA4P16410 223 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 EMDP50402 254 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ERVK-16P61578 105 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CCL8P80075 99 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 QRFPP83859 136 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CFHR1Q03591 330 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ATXN8Q156A1 80 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00643Q86TS7 51 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 KLK6Q92876 244 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF747Q9BV97 191 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LIME1Q9H400 295 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ZMAT4Q9H898 229 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 GTF3C1Q12789 2109 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 URB1O60287 2271 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PRSS38A1L453 326 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 H3BP45 60 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 H3BSH0 61 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 H3BT86 120 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 HBDP02042 147 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 GP1BBP13224 206 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NPPCP23582 126 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SYNJ2BPP57105 145 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 UBE2D3P61077 147 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 UBE2D2P62837 147 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FXYD3Q14802 87 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LINC01590Q5TEZ4 76 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SERP2Q8N6R1 65 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 WFDC11Q8NEX6 87 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 U3KQE9 123 aa3.55□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CENPEQ02224 2701 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LAMA1P25391 3075 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 MYBPHLA2RUH7 354 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PRR32B1ATL7 298 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 K7EM74 188 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 K7ESM1 405 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TCL1BO95988 128 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 IAPPP10997 89 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 HILS1P60008 231 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PRR15Q8IV56 129 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PCP2Q8IVA1 136 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 Q8N1Y9 231 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 Q8N3U1 123 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SLC25A45Q8N413 288 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00311Q8N616 119 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 OR52N5Q8NH56 324 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LINC01600Q96MT4 127 aa3.54□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRGV9Q99603 122 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms