RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561668.5

PKD1-223, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 3

Gene PKD1, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-223	ENST00000561668	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-223	ENST00000561668	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	PYY	P10082	97 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	RYR3	Q15413	4870 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	MB	P02144	154 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	AMBP	P02760	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	NEU1	Q99519	415 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668		A0A0D9SG52	128 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	C11orf94	C9JXX5	98 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668		H3BTX0	84 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	TAS2R45	P59539	299 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	RAB2A	P61019	212 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	RNF141	Q8WVD5	230 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	LY6G6C	O95867	125 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668		A0A1W2PPV4	95 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	HBE1	P02100	147 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	EMP1	P54849	157 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	OR7C2	O60412	319 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	C1QB	P02746	253 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	OR10J4	P0C629	311 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PKD1-223	ENST00000561668	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668		M0R3E3	92 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	INS	P01308	110 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	TCTA	P57738	103 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	IGLL5	B9A064	214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668		M0R2Z0	102 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	BCL2L11	O43521	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	ICAM4	Q14773	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668		Q6ZTC4	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	TMUB2	Q71RG4	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	C12orf74	Q32Q52	190 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	TSPO	P30536	169 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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