RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561300.1

TMOD2-205, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD2, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-205ENST00000561300 C9orf170A2RU37 121 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 HMSDA8MTL9 139 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 A8MWV9 139 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 H7C2G1 150 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 NPFFO15130 113 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 HIST1H2BKO60814 126 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SHBGP04278 402 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 HIST1H2BJP06899 126 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 GPX1P07203 203 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TSPAN19P0C672 248 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TRGC1P0CF51 173 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 HLA-EP13747 358 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 FGF7P21781 194 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 CD24P25063 80 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 RPL22P35268 128 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 RPL35P42766 123 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 AKR1D1P51857 326 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 DYNLT1P63172 113 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 MYL5Q02045 173 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 MEIG1Q5JSS6 88 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 C22orf39Q6P5X5 142 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 LYZL1Q6UWQ5 148 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 LCN15Q6UWW0 184 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 AAED1Q7RTV5 226 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 DEFB128Q7Z7B8 93 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 MMGT1Q8N4V1 131 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 C3orf56Q8N813 242 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 OR4S1Q8NGB4 309 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 OR4C6Q8NH72 309 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 AQP3Q92482 292 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 PRELID3AQ96N28 172 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 PDCD10Q9BUL8 212 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 RNF122Q9H9V4 155 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TAF9BQ9HBM6 251 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 COA4Q9NYJ1 87 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 FKBP11Q9NYL4 201 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 COMMD3Q9UBI1 195 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 HS3ST2Q9Y278 367 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 MCM3APO60318 1980 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 DSPPQ9NZW4 1301 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ANK1P16157 1881 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 RTL9Q8NET4 1388 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 CCNB3Q8WWL7 1395 aa0.82□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 DISP2A7MBM2 1401 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 FGD6Q6ZV73 1430 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 BRWD1Q9NSI6 2320 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 DLC1Q96QB1 1528 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 A0A0D9SG52 128 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 MEIS3P1A6NDR6 274 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 BBIP1A8MTZ0 92 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF727A8MUV8 499 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 CORTO00230 105 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 TIMM17BO60830 172 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 IFNA4P05014 189 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 METTL15P1P0C7V9 234 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SMIM6P0DI80 62 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ERHP84090 104 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF90Q03938 601 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 KLRD1Q13241 179 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 CDK5R1Q15078 307 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 CLLU1Q5K131 121 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 MED12LQ86YW9 2145 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 SNX29P2Q8IUI4 249 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 ARL17AQ8IVW1 177 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 DYNAPQ8N1N2 210 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 FAM216BQ8N7L0 139 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 LINC00301Q8NCQ3 95 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 OR5A2Q8NGI9 324 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 OR5D16Q8NGK9 328 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 OR5D14Q8NGL3 314 aa0.81□□□□□ -2.28
TMOD2-205ENST00000561300 PFN4Q8NHR9 129 aa0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms