RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	NIT2	Q9NQR4	276 aa		1.6	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		1.6	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	RPRM	Q9NS64	109 aa		1.6	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		1.6	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		1.6	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF3C1	Q12789	2109 aa		1.6	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WSZ3	146 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0J9YX75	114 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	ODF3B	A8MYP8	253 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R2P5	195 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV1-51	P01701	117 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYGA	P11844	174 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK6	Q00534	326 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFBP7	Q16270	282 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	LY6E	Q16553	131 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8IYB0	196 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5AS1	Q8N127	324 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	HYLS1	Q96M11	299 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA60	Q9H7X0	242 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK12	Q9UKR0	248 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		1.59	□□□□□ -2.15
AKAP13-223	ENST00000560957	SLIT3	O75094	1523 aa		1.59	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	DSCAM	O60469	2012 aa		1.59	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CFTR	P13569	1480 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PZP	P20742	1482 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SVIL	O95425	2214 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	hDV103S1	A0JD37	113 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM218	A2RU14	115 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	COLCA2	A8K830	154 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		E7EQL1	145 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	FNDC10	F2Z333	226 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		G3V3Q6	166 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	HYPM	O75409	117 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PROSC	O94903	275 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAC	P01848	142 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PMP2	P02689	132 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CD3D	P04234	171 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CD14	P08571	375 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A4	P12235	298 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ETV6	P41212	452 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PKIA	P61925	76 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	BLCAP	P62952	87 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF345	Q14585	488 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8N814	137 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC2B	Q92478	149 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMF1	Q92530	271 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP98	P52948	1817 aa		1.58	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR90	Q96KV7	1748 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SBF1	O95248	1867 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PNM2	257 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		A6NN06	94 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		E7EUB6	86 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R143	59 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL25	O15444	150 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	HRES1	P13985	223 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TPPP2	P59282	170 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SS18	Q15532	418 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		Q6ZUT4	128 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB37	Q96AX2	223 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957		Q96M85	177 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	NABP2	Q9BQ15	211 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		1.57	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	OBSL1	O75147	1896 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	SLIT2	O94813	1529 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		1.56	□□□□□ -2.16

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