RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF503	Q96F45	646 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	BCL2L11	O43521	198 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	PFDN1	O60925	122 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	C1QB	P02746	253 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	AMBP	P02760	352 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	FXYD7	P58549	80 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954		M0R3E3	92 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ICAM4	Q14773	271 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954		A0A0J9YWU9	116 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	MUC7	Q8TAX7	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954		M0R2Z0	102 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	MIF	P14174	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMUB2	Q71RG4	321 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954		Q9H3A6	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RABGGTA-208	ENST00000558954	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	CXorf1	O96002	111 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	INS	P01308	110 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	GCHFR	P30047	84 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	TSPO	P30536	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	CSN1S1	P47710	185 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954		Q8NAQ8	132 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954		X6R8D5	127 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954		A0A1B0GVG6	124 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	CDKN1B	P46527	198 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	STOML3	Q8TAV4	291 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	NEU1	Q99519	415 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	UMAD1	C9J7I0	102 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	LEP	P41159	167 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF726P1	Q15940	193 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZFP69	Q49AA0	526 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	DEFB4A	O15263	64 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	CD300C	Q08708	224 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RABGGTA-208	ENST00000558954	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RABGGTA-208	ENST00000558954	PGP	A6NDG6	321 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RABGGTA-208	ENST00000558954	HBE1	P02100	147 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RABGGTA-208	ENST00000558954	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RABGGTA-208	ENST00000558954	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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