RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A1B0GVY2	172 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	PRSS46	E5RG02	174 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994		H3BTX0	84 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994		K7EQG2	157 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	SPRY2	O43597	315 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	MPC2	O95563	127 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	IFNA7	P01567	189 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	PET100	P0DJ07	73 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	CXCL3	P19876	107 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	H2BFS	P57053	126 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	DEFB1	P60022	68 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RHOB	P62745	196 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	MGST2	Q99735	147 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	GGACT	Q9BVM4	153 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	ARV1	Q9H2C2	271 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	NRN1	Q9NPD7	142 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	MED9	Q9NWA0	146 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994		A8MZ25	164 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	FNDC10	F2Z333	226 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994		F5H697	171 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994		H0YIZ8	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	UBE2C	O00762	179 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	DEFB4A	O15263	64 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RAB14	P61106	215 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	B2M	P61769	119 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	IL15RA	Q13261	267 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	CLLU1	Q5K131	121 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	PATE2	Q6UY27	113 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF546	Q86UE3	836 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	OR11H2	Q8NH07	326 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	SUN5	Q8TC36	379 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	BLNK	Q8WV28	456 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RARRES2	Q99969	163 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	RPRM	Q9NS64	109 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	MBD2	Q9UBB5	411 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A1W2PPV4	95 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		F6UB75	175 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994		J3KRW8	73 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	MPDU1	O75352	247 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HTN1	P15515	57 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	HLA-DMB	P28068	263 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	MEOX2	P50222	304 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	EMP1	P54849	157 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM78B	Q5VT40	261 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TEX261	Q6UWH6	196 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	DCANP1	Q8TF63	244 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	C17orf77	Q96MU5	243 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR82	Q96P67	336 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	PFDN5	Q99471	154 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP5S	Q99766	215 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATXN3-231	ENST00000554994	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		3.4	□□□□□ -1.87

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