RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR25Q96S07 402 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ROS1P08922 2347 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BRM9 83 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 SIVA1O15304 175 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 HES1Q14469 280 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 THYN1Q9P016 225 aa7.38□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 C9orf118A6NHY6 69 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 FXYD7P58549 80 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 CFHR4Q92496 578 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 LAMA5O15230 3695 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 KALRNO60229 2985 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NPYP01303 97 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 PAX8Q06710 450 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8NA96 180 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ARPC1AQ92747 370 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.37□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1W2PRD5 423 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1W2PRF3 423 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1W2PRM7 423 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 SMKR1H3BMG3 65 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ZZEF1O43149 2961 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 S100A7P31151 101 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NMUP48645 174 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 TCTAP57738 103 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 KIR3DS1Q14943 382 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8TAT8 98 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.36□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 F8W735 103 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFS7O75251 213 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLC6P0CF74 106 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 MGAQ8IWI9 3026 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BUT2 72 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ORM1P02763 201 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 PSMG4Q5JS54 123 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 VGLL1Q99990 258 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 CACNA1HO95180 2353 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ABCA1O95477 2261 aa7.35□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 CEP250Q9BV73 2442 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A0G2JLM5 398 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 K7EP34 96 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-23P01764 117 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 KLRD1Q13241 179 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 JMJD8Q96S16 334 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 M0R1W7 72 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 PCP2Q8IVA1 136 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 TIMD4Q96H15 378 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 DKK2Q9UBU2 259 aa7.34□□□□□ -1.23
RRN3P1-202ENST00000546471 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 ODF3BA8MYP8 253 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 NDPQ00604 133 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01560Q8TB33 94 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 C18orf15Q96N68 181 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 CNFNQ9BYD5 112 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01546A6NGU7 62 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 FCER1GP30273 86 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 LEPP41159 167 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01559Q495D7 138 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 PIFOQ8TCI5 191 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 RNF185Q96GF1 192 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RRN3P1-202ENST00000546471 CTSGP08311 255 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms