RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.76□□□□□ -0.21
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CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM231AP0DMU4 169 aa13.76□□□□□ -0.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM231CP0DMU5 169 aa13.76□□□□□ -0.21
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.74□□□□□ -0.21
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CD27-AS1-208ENST00000538616 HBE1P02100 147 aa13.72□□□□□ -0.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 AMBPP02760 352 aa13.72□□□□□ -0.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 GUK1Q16774 197 aa13.72□□□□□ -0.21
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CD27-AS1-208ENST00000538616 MED28Q9H204 178 aa13.72□□□□□ -0.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 WFDC1Q9HC57 220 aa13.72□□□□□ -0.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 PKD1P98161 4303 aa13.72□□□□□ -0.21
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CD27-AS1-208ENST00000538616 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.71□□□□□ -0.21
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CD27-AS1-208ENST00000538616 RRN3P1Q2M238 152 aa13.71□□□□□ -0.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.71□□□□□ -0.21
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CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFB4O95168 129 aa13.7□□□□□ -0.22
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CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.7□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSPG2P98160 4391 aa13.69□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 M0R3E3 92 aa13.69□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.69□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.69□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.69□□□□□ -0.22
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CD27-AS1-208ENST00000538616 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.69□□□□□ -0.22
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CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF253O75346 499 aa13.68□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFNA5P01569 189 aa13.68□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q5BKY6 102 aa13.68□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.68□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.68□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC01587Q99440 93 aa13.68□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 J3KRW8 73 aa13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR10J4P0C629 311 aa13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 AZU1P20160 251 aa13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDKN1BP46527 198 aa13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR51M1Q9H341 326 aa13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 FUT9Q9Y231 359 aa13.67□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 CT45A10P0DMU9 189 aa13.66□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTN1P15515 57 aa13.66□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERCC8Q13216 396 aa13.66□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.66□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 PAXXQ9BUH6 204 aa13.66□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 HERC1Q15751 4861 aa13.65□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.65□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDE6HQ13956 83 aa13.65□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ICAM4Q14773 271 aa13.65□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 FXYD5Q96DB9 178 aa13.65□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF503Q96F45 646 aa13.65□□□□□ -0.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.64□□□□□ -0.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR7C2O60412 319 aa13.64□□□□□ -0.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGS21Q2M5E4 152 aa13.64□□□□□ -0.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.64□□□□□ -0.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.64□□□□□ -0.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q6ZR54 194 aa13.64□□□□□ -0.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q8N1X5 172 aa13.64□□□□□ -0.23
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