RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528749.1

SETDB1-215, Transcript of SET domain bifurcated 1, human

TSL 3

Gene SETDB1, Length 527 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETDB1-215	ENST00000528749	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	MGST2	Q99735	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	CENPX	A8MT69	81 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749		H3BQ15	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	SLC17A3	O00476	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	NMB	P08949	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	IL7	P13232	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	M6PR	P20645	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	RHOB	P62745	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	IL15RA	Q13261	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	OPCML	Q14982	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	FCN2	Q15485	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749		Q8N3U1	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749		Q9H3A6	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	KLLN	B2CW77	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	PLA2G10	O15496	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	NUDT3	O95989	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	HOXA5	P20719	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	CAMLG	P49069	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	INPP1	P49441	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	RAB31	Q13636	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	PDE6H	Q13956	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749		Q6ZRG5	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	PFDN5	Q99471	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749		Q9H8V8	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SETDB1-215	ENST00000528749	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	MPDU1	O75352	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	CRISP2	P16562	243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	LEP	P41159	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	SULT1A1	P50225	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	NDUFB4	O95168	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	RLN2	P04090	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	TCRB	P04435	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	S100A11	P31949	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	CLINT1	Q14677	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	ESRG	Q1W209	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETDB1-215	ENST00000528749	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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