RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526035.5

BBS1-209, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 822 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-209	ENST00000526035	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	ISLR	O14498	428 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	IFNA7	P01567	189 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	NDUFB4	O95168	129 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	PSMB3	P49720	205 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	BLOC1S1	P78537	153 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	PSG9	Q00887	426 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035		H3BTX0	84 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	SLC17A3	O00476	420 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	HBE1	P02100	147 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF688	P0C7X2	276 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	LINC00052	Q96N35	136 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035		A0A0J9YWU9	116 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	DEFB131A	P59861	70 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	PSG3	Q16557	428 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	PSMG4	Q5JS54	123 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	PRELID1	Q9Y255	219 aa		10.84	□□□□□ -0.67
BBS1-209	ENST00000526035	PPT1	P50897	306 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	IFITM2	Q01629	132 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035		Q9H3A6	140 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035		A0A1W2PRE2	83 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	PGP	A6NDG6	321 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	CCL20	P78556	96 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		10.82	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035		A0A1B0GV50	99 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	ICAM4	Q14773	271 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	FAM74A7	A6NL05	159 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035		M0R3E3	92 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	CSN1S1	P47710	185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	UBE2G2	P60604	165 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		10.79	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035		A0A0J9YX75	114 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	KNCN	A6PVL3	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035		H3BMM0	161 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	PAGE4	O60829	102 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	NMB	P08949	121 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF124	Q15973	351 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	GNG13	Q9P2W3	67 aa		10.78	□□□□□ -0.68
BBS1-209	ENST00000526035	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-209	ENST00000526035	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-209	ENST00000526035	SPRY2	O43597	315 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-209	ENST00000526035	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-209	ENST00000526035	IFNA1	P01562	189 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-209	ENST00000526035	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-209	ENST00000526035	HLA-DRB4	P13762	266 aa		10.77	□□□□□ -0.69
BBS1-209	ENST00000526035	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69

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