RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZR54 194 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF709Q8N972 641 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GPR146Q96CH1 333 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 C2orf48Q96LS8 159 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 XCL2Q9UBD3 114 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GPR132Q9UNW8 380 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 AGRNO00468 2067 aa4.77□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 A4D1N5 150 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 IFNA10P01566 189 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 AKAIN1P0CW23 69 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 ANXA3P12429 323 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 S100A7P31151 101 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SMCO1Q147U7 214 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 LGI3Q8N145 548 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 OR4C16Q8NGL9 310 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 COQ8AQ8NI60 647 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 DTD1Q8TEA8 209 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 ACY3Q96HD9 319 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SCGB3A2Q96PL1 93 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 VGLL1Q99990 258 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 A0A0J9YX75 114 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 ZFP92A6NM28 416 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SNRPGP15A8MWD9 76 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 HBE1P02100 147 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A6P12236 298 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 TSPOP30536 169 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 B2MP61769 119 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 PSG9Q00887 426 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GAMTQ14353 236 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 LCE1FQ5T754 118 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GPR141Q7Z602 305 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35E1Q96K37 410 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GPR82Q96P67 336 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 TRGV9Q99603 122 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SPXQ9BT56 116 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 MIXL1Q9H2W2 232 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 RPRMQ9NS64 109 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 C5orf52A6NGY3 159 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 LYRM9A8MSI8 78 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 AKR1C4P17516 323 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GALR1P47211 349 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 RAB11AP62491 216 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 RRN3P1Q2M238 152 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 OR51S1Q8NGJ8 323 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 DEDD2Q8WXF8 326 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 DOK5Q9P104 306 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 RGS5O15539 181 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 PITX3O75364 302 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 INSP01308 110 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 FAUP35544 74 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 EMP1P54849 157 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 LYZP61626 148 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF90Q03938 601 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 LCE1EQ5T753 118 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 FAM78BQ5VT40 261 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 AMTNQ6UX39 209 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35B3Q9H1N7 401 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 RBKSQ9H477 322 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS46E5RG02 174 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 MED6O75586 246 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-222ENST00000514552 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms