RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 HIST1H2BOP23527 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST1H2BBP33778 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 CTRLP40313 264 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST1H2BDP58876 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST1H2BCP62807 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ZNF56Q15929 161 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 VSIRQ9H7M9 311 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 NUP35Q8NFH5 326 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 BUB3O43684 328 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 IGKV1-17P01599 117 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HLA-DRB4P13762 266 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 LINC01587Q99440 93 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ZNF581Q9P0T4 197 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 CACNA1HO95180 2353 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 NMUP48645 174 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 GATD1Q8NB37 220 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 GTF3C1Q12789 2109 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 A1L4Q6 167 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 H7C423 109 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 IGLC2P0DOY2 106 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 GGTLC3B5MD39 225 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 RNF223E7ERA6 249 aa4.57□□□□□ -1.68
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POLK-215ENST00000514141 DDTP30046 118 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 MSMPQ1L6U9 139 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.57□□□□□ -1.68
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POLK-215ENST00000514141 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 DYSFO75923 2080 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.57□□□□□ -1.68
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POLK-215ENST00000514141 Q6ZVH6 145 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 IL17DQ8TAD2 202 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.57□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 EYSQ5T1H1 3165 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ADMP35318 185 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 SPATA45Q537H7 98 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 MUC7Q8TAX7 377 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 RASL10AQ92737 203 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ESPL1Q14674 2120 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 MED12LQ86YW9 2145 aa4.56□□□□□ -1.68
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POLK-215ENST00000514141 C16orf74Q96GX8 76 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 TMEM238C9JI98 176 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 M0R2P5 195 aa4.56□□□□□ -1.68
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POLK-215ENST00000514141 RCHY1Q96PM5 261 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 C16orf95Q9H693 158 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.56□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 SAP30O75446 220 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 APOMO95445 188 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ADCYAP1P18509 176 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ZNF843Q8N446 348 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 GLMPQ8WWB7 406 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 C5orf30Q96GV9 206 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
POLK-215ENST00000514141 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.55□□□□□ -1.68
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