RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	MFF	Q9GZY8	342 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	HMSD	A8MTL9	139 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	FXYD7	P58549	80 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB2A	P61019	212 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	SERF2	P84101	59 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF141	Q8WVD5	230 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	PAXX	Q9BUH6	204 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	TAAR5	O14804	337 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10J4	P0C629	311 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	MIF	P14174	115 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	TAS2R45	P59539	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF345	Q14585	488 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	NEU1	Q99519	415 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRELID1	Q9Y255	219 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0R3E3	92 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR7C2	O60412	319 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	AMBP	P02760	352 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	KHDC3L	Q587J8	217 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	BLNK	Q8WV28	456 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PPV4	95 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0R2Z0	102 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	MB	P02144	154 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	STAG3L2	P0CL84	134 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	STAG3L3	P0CL85	134 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	ICAM4	Q14773	271 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB24	Q969Q5	203 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	DEFB4A	O15263	64 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	LY6G6C	O95867	125 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0D9SG52	128 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	INS	P01308	110 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	CT45A10	P0DMU9	189 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDKN1B	P46527	198 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	SUN5	Q8TC36	379 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q9H3A6	140 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSPO	P30536	169 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	BCL2L11	O43521	198 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF726P1	Q15940	193 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSX7	Q7RTT5	188 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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