RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-222ENST00000512014 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-222ENST00000512014 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-222ENST00000512014 PFDN5Q99471 154 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-222ENST00000512014 MPDU1O75352 247 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 NDUFB4O95168 129 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 AZU1P20160 251 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 THAP6Q8TBB0 222 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 RLN2P04090 185 aa9.01□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.01□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.01□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 CT45A10P0DMU9 189 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 TSPOP30536 169 aa9□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 MIR17HGQ75NE6 70 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM208Q9BTX3 173 aa9□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 HSPB11Q9Y547 144 aa8.99□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF503Q96F45 646 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 LINC01587Q99440 93 aa8.98□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 PKHD1P08F94 4074 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 LYRM9A8MSI8 78 aa8.97□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 PDE6HQ13956 83 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-222ENST00000512014 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.97□□□□□ -0.97
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SH3BP2-222ENST00000512014 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 PKD1P98161 4303 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 H7BYZ3 331 aa8.95□□□□□ -0.98
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SH3BP2-222ENST00000512014 HTN3P15516 51 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 OR51M1Q9H341 326 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 FUT9Q9Y231 359 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 PRELID1Q9Y255 219 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 NACAE9PAV3 2078 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 KLLNB2CW77 178 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 J3KRW8 73 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 OR10J4P0C629 311 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 PET100P0DJ07 73 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP2-222ENST00000512014 DEFB130BP0DP73 79 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP2-222ENST00000512014 HTN1P15515 57 aa8.94□□□□□ -0.98
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SH3BP2-222ENST00000512014 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 C16orf74Q96GX8 76 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 LEPP41159 167 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP2-222ENST00000512014 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.93□□□□□ -0.98
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