RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	XCL2	Q9UBD3	114 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	M6PR	P20645	277 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	OR7C2	O60412	319 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	FXYD7	P58549	80 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		X6R8D5	127 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PPV4	95 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	TAAR5	O14804	337 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	AMBP	P02760	352 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	MIF	P14174	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF345	Q14585	488 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MIB2-223	ENST00000508148	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	OR10J4	P0C629	311 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	RAB2A	P61019	212 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	SERF2	P84101	59 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	IGLL5	B9A064	214 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFB4	O95168	129 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	MB	P02144	154 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZTC4	211 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	INS	P01308	110 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148		M0R2Z0	102 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148		M0R3E3	92 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	TCTA	P57738	103 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZNX1	250 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	NEU1	Q99519	415 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	ICAM4	Q14773	271 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0D9SG52	128 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	CDKN1B	P46527	198 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MIB2-223	ENST00000508148	PKHD1	P08F94	4074 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MIB2-223	ENST00000508148	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
MIB2-223	ENST00000508148	TSPO	P30536	169 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MIB2-223	ENST00000508148	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MIB2-223	ENST00000508148		Q9H3A6	140 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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