RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495949.1

RALGAPB-208, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 3

Gene RALGAPB, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-208	ENST00000495949	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CRYBB3	P26998	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	GALR1	P47211	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MEOX2	P50222	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PEA15	Q15121	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	GUK1	Q16774	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	F8	P00451	2351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949		A0A087WW49	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949		A0A1B0GV50	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	HELT	A6NFD8	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949		H3BRN7	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CCL24	O00175	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	GCHFR	P30047	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949		A0A1W2PRE2	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949		A8MWP6	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949		F6UZH7	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	MYCNOS	P40205	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PSG9	Q00887	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PDE6H	Q13956	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949		K7EQM0	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OVOL1	O14753	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	PDE6D	O43924	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	OR10J4	P0C629	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	BCL2	P10415	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RALGAPB-208	ENST00000495949	CBLN1	P23435	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms