RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290		H3BTX0	84 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	CD300C	Q08708	224 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB135	Q30KP9	77 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB24	Q969Q5	203 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	RETN	Q9HD89	108 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HCLS1-208	ENST00000487290	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	SPRY2	O43597	315 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10J4	P0C629	311 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF726P1	Q15940	193 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	UMAD1	C9J7I0	102 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	SSX7	Q7RTT5	188 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	PFDN1	O60925	122 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	AMBP	P02760	352 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	BLNK	Q8WV28	456 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.06	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290		M0R3E3	92 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	CXorf1	O96002	111 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	GCHFR	P30047	84 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZFP69	Q49AA0	526 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		12.05	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ICAM4	Q14773	271 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC51B	Q86UW2	128 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290		Q9H3A6	140 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		12.04	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	RBAKDN	A6NC62	111 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	NEU1	Q99519	415 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290		X6R8D5	127 aa		12.03	□□□□□ -0.48
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.02	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PRE2	83 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV3-20	P01619	116 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8NAQ8	132 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	TMED6	Q8WW62	240 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	RARRES2	Q99969	163 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		12.01	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	MIF	P14174	115 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	CRISP2	P16562	243 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	CDKN1B	P46527	198 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB5C	P51148	216 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00477	Q96M19	166 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	DIRC3	C9JPN6	131 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	INS	P01308	110 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	NMB	P08949	121 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	FHIT	P49789	147 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-208	ENST00000487290	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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