RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 GLTPQ9NZD2 209 aa2.27□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 DENRO43583 198 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 CDRT1O95170 752 aa2.26□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.26□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.26□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.25□□□□□ -2.05
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SHQ1-208ENST00000482785 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 KCNJ8Q15842 424 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 SNCBQ16143 134 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-208ENST00000482785 HIST2H3AQ71DI3 136 aa2.24□□□□□ -2.05
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