RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 KHDC3LQ587J8 217 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 OR11H2Q8NH07 326 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 RAB24Q969Q5 203 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 PAXXQ9BUH6 204 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 OR51M1Q9H341 326 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 C11orf94C9JXX5 98 aa8.41□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 NRN1Q9NPD7 142 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.41□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 LCN15Q6UWW0 184 aa8.4□□□□□ -1.06
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GARNL3-217ENST00000481875 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 STAG3L2P0CL84 134 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 STAG3L3P0CL85 134 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 FHITP49789 147 aa8.39□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 PKHD1P08F94 4074 aa8.39□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.38□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 APLNQ9ULZ1 77 aa8.38□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 HERC2O95714 4834 aa8.37□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1B0GV50 99 aa8.37□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 TEX46H3BTG2 121 aa8.37□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 TEX261Q6UWH6 196 aa8.37□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 FXYD5Q96DB9 178 aa8.37□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.37□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.37□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 BLOC1S1P78537 153 aa8.36□□□□□ -1.07
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GARNL3-217ENST00000481875 PSMG4Q5JS54 123 aa8.36□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 STHQ8IWL8 128 aa8.36□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.36□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.36□□□□□ -1.07
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.36□□□□□ -1.07
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