RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 SMIM12Q96EX1 92 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 SFRP2Q96HF1 295 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 OSTCQ9NRP0 149 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 SMPXQ9UHP9 88 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 V9GYV3 84 aa7.34□□□□□ -1.23
ITGA6-210ENST00000475302 ZFHX3Q15911 3703 aa7.34□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.33□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.33□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.33□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 A0A087WW49 117 aa7.32□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 A8MWP6 167 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 H7BYZ3 331 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 CHEK1O14757 476 aa7.32□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 IL36BQ9NZH7 164 aa7.3□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.3□□□□□ -1.24
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ITGA6-210ENST00000475302 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 RBAKDNA6NC62 111 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 ERVFC1-1P60608 527 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2G1P62253 170 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF575Q86XF7 245 aa7.29□□□□□ -1.24
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