RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0G2JRQ6 117 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 USP17L23D6RBM5 183 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 RGS10O43665 173 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 PRSS1P07477 247 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 TAS2R46P59540 309 aa8.29□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 BTN1A1Q13410 526 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 AARDQ4LEZ3 155 aa8.29□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 UBE2WQ96B02 151 aa8.29□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 U3KQ87 197 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 H3BRN7 92 aa8.28□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-211ENST00000463372 MEF2DQ14814 521 aa8.28□□□□□ -1.08
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C9orf3-211ENST00000463372 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-211ENST00000463372 Q8TAT8 98 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-211ENST00000463372 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.26□□□□□ -1.09
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C9orf3-211ENST00000463372 A6NJ64 397 aa8.23□□□□□ -1.09
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C9orf3-211ENST00000463372 OR52I2Q8NH67 350 aa8.23□□□□□ -1.09
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C9orf3-211ENST00000463372 S100A7AQ86SG5 101 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf3-211ENST00000463372 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf3-211ENST00000463372 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.22□□□□□ -1.09
C9orf3-211ENST00000463372 PTGES3LE9PB15 166 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 CIB2O75838 187 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 OR5G3P0C626 314 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 RNF24Q9Y225 148 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 HYPMO75409 117 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 PI3P19957 117 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 HLA-DMAP28067 261 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 RCVRNP35243 200 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.2□□□□□ -1.1
C9orf3-211ENST00000463372 DTD1Q8TEA8 209 aa8.2□□□□□ -1.1
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