RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR51M1Q9H341 326 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRELID1Q9Y255 219 aa8.1□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMSDA8MTL9 139 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PYYP10082 97 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 M6PRP20645 277 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RHOBP62745 196 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF738Q8NE65 137 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SUN5Q8TC36 379 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ODF3Q96PU9 254 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RFNGQ9Y644 331 aa8.09□□□□□ -1.11
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRAC2D3DTV9 90 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BTX0 84 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAAR5O14804 337 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV3-20P01619 116 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP6V0CP27449 155 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF345Q14585 488 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XP32Q5T750 250 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZNX1 250 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF141Q8WVD5 230 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PAXXQ9BUH6 204 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MFFQ9GZY8 342 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.08□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBP02144 154 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSPOP30536 169 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.07□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM189A5PLL7 270 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 M0R3E3 92 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JTBO76095 146 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NMBP08949 121 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAG3L2P0CL84 134 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STAG3L3P0CL85 134 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDKN1BP46527 198 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAS2R45P59539 299 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KHDC3LQ587J8 217 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00477Q96M19 166 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.06□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 M0R2Z0 102 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CT45A10P0DMU9 189 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FXYD7P58549 80 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB2AP61019 212 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBAKDNA6NC62 111 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUPR2A6NF83 97 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLLNB2CW77 178 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFB4AO15263 64 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARPC5O15511 151 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR7C2O60412 319 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INSP01308 110 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10J4P0C629 311 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CRISP2P16562 243 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ICAM4Q14773 271 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BLNKQ8WV28 456 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0D9SG52 128 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCE6AA0A183 80 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1W2PPV4 95 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C11orf94C9JXX5 98 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRN3P1Q2M238 152 aa8.03□□□□□ -1.12
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C12orf74Q32Q52 190 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms