RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BTX0	84 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	HBG1	P69891	147 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	HBG2	P69892	147 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	STX12	Q86Y82	276 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01587	Q99440	93 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	PFDN5	Q99471	154 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPG2	P98160	4391 aa		12.5	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	BAX	Q07812	192 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	GUK1	Q16774	197 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF212	Q495C1	297 aa		12.49	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF253	O75346	499 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	UPK1B	O75841	260 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf74	Q96GX8	76 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.48	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738		H7BYZ3	331 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB130B	P0DP73	79 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB130A	P0DP74	79 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	FGF7	P21781	194 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	IFITM3	Q01628	133 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	FCN2	Q15485	313 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738		Q6ZR54	194 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF575	Q86XF7	245 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	MPDU1	O75352	247 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	NMES1	Q9C002	83 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	CBY3	A6NI87	242 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	SIX6	O95475	246 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	CT45A10	P0DMU9	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	NHLH2	Q02577	135 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YIZ8	118 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAF2	O60831	178 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFB4	O95168	129 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5G1	P05496	136 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	HTN1	P15515	57 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5G3	P48201	142 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738		E5RGE8	158 aa		12.43	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE6H	Q13956	83 aa		12.43	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		12.43	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		12.43	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		12.43	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738		F5H768	121 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R3E3	92 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	RLN2	P04090	185 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	PYY	P10082	97 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	LEP	P41159	167 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP6	Q8TBB0	222 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	PRELID1	Q9Y255	219 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	H2BFS	P57053	126 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	KLLN	B2CW77	178 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	CLINT1	Q14677	625 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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