RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 CLEC5AQ9NY25 188 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 PSG9Q00887 426 aa22.05■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV3-20P01619 116 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF726P1Q15940 193 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 Q6ZWC4 215 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 OR4B1Q8NGF8 309 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 PHYHIPLQ96FC7 376 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 CA1P00915 261 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 ARL14EPLP0DKL9 152 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB135Q30KP9 77 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 CLUHP3Q96NS8 147 aa22.04■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 PRAC2D3DTV9 90 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 RCHY1Q96PM5 261 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 U3KQK5 164 aa22.03■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 M0R3E3 92 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 OR8A1Q8NGG7 326 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 OVOL2Q9BRP0 275 aa22.02■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 A8MTW9 85 aa22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 CNN1P51911 297 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 AAMDCQ9H7C9 122 aa22■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 RANP62826 216 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 ICAM4Q14773 271 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 RNF183Q96D59 192 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 UMAD1C9J7I0 102 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 ALKAL2Q6UX46 152 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 PRELID1Q9Y255 219 aa21.99■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 STAB2Q8WWQ8 2551 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 GCHFRP30047 84 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 FHITP49789 147 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 FAM74A1Q5RGS3 127 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 AMTNQ6UX39 209 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 SLC35B3Q9H1N7 401 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa21.98■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 SPRY2O43597 315 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 CXorf1O96002 111 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 LYPD1Q8N2G4 141 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 SUN5Q8TC36 379 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 Q9H3A6 140 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 FXYD7P58549 80 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 SULT1A2P50226 295 aa21.95■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 XCL2Q9UBD3 114 aa21.95■■□□□ 1.11
PKDCC-202ENST00000401498 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 TEX261Q6UWH6 196 aa21.94■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 OR10J6PQ8NGY7 276 aa21.94■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 RAB5CP51148 216 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 DPPA3Q6W0C5 159 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 FAM213BQ8TBF2 198 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM167BQ9NRX6 74 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 OTORQ9NRC9 128 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 PGPA6NDG6 321 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 IQCF2Q8IXL9 164 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 NPIPB6E9PJ23 425 aa21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF680Q8NEM1 530 aa21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-202ENST00000401498 M0R2Z0 102 aa21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 SPINK13Q1W4C9 94 aa21.89■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 ERCC8Q13216 396 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 MBD3L1Q8WWY6 194 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 RARRES2Q99969 163 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 OR11H2Q8NH07 326 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 CT45A10P0DMU9 189 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 CSN1S1P47710 185 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 RXFP4Q8TDU9 374 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 CRXO43186 299 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 SFT2D1Q8WV19 159 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 VGLL1Q99990 258 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 DIRC3C9JPN6 131 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 IFNA7P01567 189 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 IFITM2Q01629 132 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 CMTM2Q8TAZ6 248 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 LINC00477Q96M19 166 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 EDA2RQ9HAV5 297 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 AMBPP02760 352 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 X6R8D5 127 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PRE2 83 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms