RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 HIGD1BQ9P298 99 aa13.3□□□□□ -0.28
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GDE1-201ENST00000353258 AMTNQ6UX39 209 aa13.29□□□□□ -0.28
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GDE1-201ENST00000353258 ZNF502Q8TBZ5 544 aa13.23□□□□□ -0.29
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GDE1-201ENST00000353258 C12orf74Q32Q52 190 aa13.22□□□□□ -0.29
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GDE1-201ENST00000353258 SHISA9B4DS77 424 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 THBDP07204 575 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 LEPP41159 167 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 Q8NA96 180 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 C17orf100A8MU93 164 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 M0R3E3 92 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 APOMO95445 188 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 FCN3O75636 299 aa13.2□□□□□ -0.3
GDE1-201ENST00000353258 PSMG4Q5JS54 123 aa13.2□□□□□ -0.3
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