RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 C4orf26Q17RF5 130 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 MPV17L2Q567V2 206 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TMEM126AQ9H061 195 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FCN1O00602 326 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 HBG1P69891 147 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 HBG2P69892 147 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.8□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WX48 190 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CLDN34H7C241 214 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FGF16O43320 207 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CA2P00918 260 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 BAGE3Q86Y29 109 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 BAGE2Q86Y30 109 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 ATOH7Q8N100 152 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 ACY3Q96HD9 319 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C9JQL5 133 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
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CCR6-201ENST00000341935 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 RAB37Q96AX2 223 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FSHBP01225 129 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 LINC00694P0DN24 101 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 ERHP84090 104 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 BTNL8Q6UX41 500 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.79□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FAM231BA6NCW3 169 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TEX22C9J3V5 150 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 PRSS46E5RG02 174 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FAM236CP0DP71 79 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 WT1-ASQ06250 92 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 GAGE2BQ13066 116 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 VWC2Q2TAL6 325 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 GAGE2EQ4V326 116 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C2orf83Q53S99 150 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 PIFOQ8TCI5 191 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C1RLQ9NZP8 487 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 POLQO75417 2590 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 IGLC2P0DOY2 106 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 IGLC3P0DOY3 106 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FABP2P12104 132 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 MUC21Q5SSG8 566 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 Q8N9W7 124 aa4.78□□□□□ -1.64
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CCR6-201ENST00000341935 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 IGLC7A0M8Q6 106 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TAX1BP3O14907 124 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 HBE1P02100 147 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TVP23CQ96ET8 276 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
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CCR6-201ENST00000341935 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SPG11Q96JI7 2443 aa4.78□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.78□□□□□ -1.64
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CCR6-201ENST00000341935 FXYD3Q14802 87 aa4.77□□□□□ -1.65
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CCR6-201ENST00000341935 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 A6NDN8 102 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 HLA-DRB1P01911 266 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 MT-ND6P03923 174 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 APELAP0DMC3 54 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.77□□□□□ -1.65
CCR6-201ENST00000341935 TMEM219Q86XT9 240 aa4.77□□□□□ -1.65
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