RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 CSTL1Q9H114 145 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-201ENST00000309641 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R45P59539 299 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF253O75346 499 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 GCHFRP30047 84 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 APOC4P55056 127 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 PDE6HQ13956 83 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 AMTNQ6UX39 209 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 XCL2Q9UBD3 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 ERCC8Q13216 396 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 RCHY1Q96PM5 261 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 Q9H3A6 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 A0A1B0GV50 99 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 A8MTW9 85 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 M0R2Z0 102 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 KIR3DS1Q14943 382 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SLC51BQ86UW2 128 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 PGPA6NDG6 321 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CXorf1O96002 111 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 PSG9Q00887 426 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZWC4 215 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SUN5Q8TC36 379 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SPATA25Q9BR10 227 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 ZMAT4Q9H898 229 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 U3KQK5 164 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 UMAD1C9J7I0 102 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CT45A10P0DMU9 189 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 GNG5P63218 68 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 RNF183Q96D59 192 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 VGLL1Q99990 258 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 GGTLC3B5MD39 225 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2CO00762 179 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SPRY2O43597 315 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2G2P60604 165 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 PRM2P04554 102 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SULT1A2P50226 295 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 CCL20P78556 96 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 Q8TAT8 98 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 PRELID1Q9Y255 219 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 J3KRW8 73 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 OR11H2Q8NH07 326 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SGK494Q96LW2 274 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 OTORQ9NRC9 128 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 DIRC3C9JPN6 131 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 DEFB4AO15263 64 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms