RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SORCS1-201ENST00000263054 M0R1W7 72 aa11.67□□□□□ -0.54
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SORCS1-201ENST00000263054 CRYGSP22914 178 aa11.67□□□□□ -0.54
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SORCS1-201ENST00000263054 CR1LQ2VPA4 569 aa11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-201ENST00000263054 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-201ENST00000263054 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SORCS1-201ENST00000263054 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.65□□□□□ -0.54
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SORCS1-201ENST00000263054 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.65□□□□□ -0.54
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SORCS1-201ENST00000263054 IGKV1D-39P04432 117 aa11.65□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 DEFB136Q30KP8 78 aa11.65□□□□□ -0.55
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SORCS1-201ENST00000263054 LIME1Q9H400 295 aa11.64□□□□□ -0.55
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SORCS1-201ENST00000263054 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.63□□□□□ -0.55
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SORCS1-201ENST00000263054 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 J3QKU1 62 aa11.62□□□□□ -0.55
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SORCS1-201ENST00000263054 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.62□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 J3QRE1 110 aa11.61□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM242Q9NWH2 141 aa11.61□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 SIGMAR1Q99720 223 aa11.61□□□□□ -0.55
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SORCS1-201ENST00000263054 C22orf46C9J442 243 aa11.61□□□□□ -0.55
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SORCS1-201ENST00000263054 UBE2E1P51965 193 aa11.6□□□□□ -0.55
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SORCS1-201ENST00000263054 IGHV1-69P01742 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 ID3Q02535 119 aa11.6□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 NRGNQ92686 78 aa11.6□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.6□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SORCS1-201ENST00000263054 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.6□□□□□ -0.55
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